当然现在东林党也没空来理商毅，他们的注意力都放在朱由崧登基这一大事上，当然真正关心的，其实还是自各在朝廷的地位和势力因为朱由崧登基以成定局，那么就尽可能多的在朝廷，由其是在内阁安插人手，执掌朝政，也不失为是一个补救的办法但马士英自然也不会放弃自己的权利，虽然他是拥立朱由崧继位的首席功臣，但如果不能入阁理事，那么一切就都成了浮云
明朝的内阁制度首创于永乐年间，正式形成于宣德年间，一直到在正德年间，才逐渐成熟完善，因此尽管在后来明朝出现了两个二十多年不上朝理事的皇帝，但依然沒有大乱，内阁是起了相当大的作用内阁的人选，一直没有定数，最多的时候有七人，最少只有一个，但在正徳之后的大多数时间里，一般都保持在四到五人之间，而围绕着朝的内阁成员的人选，又展开了一轮激烈的争吵
而这一次出风头的，是上一次拥立朱由崧为帝时，被给事李沾之抢了先的诚意伯刘孔昭在史可法宣布推荐內阁戍员之后，刘孔昭首先出列，居然推荐自己入阁这一下顿时上下大哗，史可法也被弄哭笑不得，只好道：“勋臣入阁办事，本朝尚无先例”
刘孔昭马上接了一句：“即我不可，马瑶草马士英字瑶草有何不可？”其实刘孔昭也知道，自己是肯定入不了內阁，自荐不过是个幌，重点是推荐马士英入阁，这样一来，自己在马士英心里的地位，也就大不一样了
众人见他推出了马士英，一来是惧怕马士英的势力，二来也怕刘孔昭再发骠，因此也只好默认了下来随后东林党赶忙出动，推出了史可法、吴牲、姜日广、王铎四名人选，五名內阁成员就这样定了下来
就在崇祯五月十五日，朱由崧在武英殿正式继位，改元弘光，明年既为弘光元年
任命史可法为东阁大学士、礼部尚书、内阁首辅，并加太太保；马士英为东阁大学士、兵部尚书兼凤阳总督，右都御史、内阁次辅；吴甡为户部尚书、左都御史、东阁大学士；詹事府詹事姜曰广为礼部左侍郎，与原南京礼部尚书王铎也同兼东阁大学士，三人也都入阁理事
同时又以张慎言为吏部尚书，刘宗周为都察院左都御史，高弘图户部左侍郎，升吕大器吏部左侍郎，李沾太常少卿，郭维经应天府丞，起徐石麟都察院左都御史，张国维兵部尚书协理戎政，黄道周、何楷、张有誉、王心一、何应瑞、高倬、解学龙、贺世寿、黄宗羲等人，也都得到了启用
在内廷方面，王徳化虽然没有像另一时空一样投降清朝，但在弘光朝，靠着商毅也有捧回遗诏玉玺之功，仍然出任司礼监掌印太监，还是实现了在这个位置上的帽戏法当然他也许还有机会来一次连下四城内廷的另一个重要位置，司礼监秉笔太监，则甴在朱甴崧登基立下大功的太监卢徳出任，同时他还付责掌管锦衣卫沈扬、刘知用、赵从夫等锦衣卫人员，也都各复原职，每个人还都加封了虚衔
而另一位重要的内廷人员，南京的镇守太监韩赞周，则因为没有位置，而被挤出了南京，接替郑敬高，出任江苏织造太监
总体来看，东林党和马党基本都达到了自己的目标，东林党不仅抢到了最有价值的內阁首辅位置，而且在五名内阁成员占了三席，同时朝近半重要的官职也都被东林党占据，可以算是弘光朝廷的第一大势力
但马士英尽管没有取得内阁首辅的位置，但也如愿以偿的进入内阁，而且还是内阁次辅，也为以后夺权，打下了一个好的基础