“请殿下立即率军撤往孟艮一带，背靠缅甸，以图再举”，张国柱劝说。
“也唯有如此了”，吴应麒长叹了口气，下令准备撤退。
撤退之事又岂是容易办到的？且不说大军所需的粮秣，将士们的家眷又该如何处置？吴军家眷多在昆明附近，约有十余万之多，如此多的家眷，仓促之下肯定无法全部带走。周王打算撤退的消息传开后，舍不得抛妻弃子的吴军将士顿时人心惶惶，一夜之间，竟逃走万余。
卫军的速度极快，吴应麒尚未离城，便已行至城下。在先前的屠杀中侥幸逃脱的郭壮图之子郭宗汾煽动父亲旧部打开了城门，卫军一涌而入，尤其以初降卫军的武定总兵韩天福、永宁总兵宋国辅、鹤丽总兵李发美、临安总兵李玉彬四将最为积极，率军猛冲猛打，斩杀吴总兵王屏铎。张国柱逃脱不及，被卫军包围于城中，力战而亡。
吴应麒只带数千吴军逃出昆明，立功心切的西日莫亲领骑兵追之，于新化州地界追上吴军，阵斩吴应麒，俘获其两个儿子吴世琚和吴世珵。至此，吴周朝廷彻底灭亡。
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当莲花大可汗率三十七万大军进入昆明时，西日莫带着吴应麒的尸身前来报捷。苏勒坦大喜，抚其背赞道：“只带四万人便平定了云南一省，不愧是卫拉特之狼啊！”
大可汗下令在昆明设宴犒赏三军，同时派人招抚丽江土知府木懿、景东土知府陶斗、蒙化土知府左星海、富州土知州沈昆瑺等地方土司势力。这些人皆十分识相，纷纷派使者表达臣服之意。
然后，大可汗再次下令将前些日子抓获的刘茂遐、刘之复父子带入大帐。他笑眯眯地问刘茂遐：“吴周已灭，先生肯降否？”
“人各有志，您又何必强求？请速杀吾”，岂料刘茂遐已萌死志，仍不肯从。
“求死不过是匹夫之勇，活着才是大丈夫。来人，将那两个孩子带上来”。
左右押着两个小孩进入大帐，苏勒坦冷笑着对刘茂遐说：“此乃吴三桂之孙、吴应麒之子，也是吴家仅存的血脉。先生若肯降，朕便饶这两个稚子不死，不光是他俩，吴三桂的正妻张氏及其他女眷，还有俘虏的吴军将领李本深、石玉贵等人，也一并饶恕死罪，仅流放至宁古塔。如何？”
“陛下雄霸天下，以此要挟，太失帝王气度！”刘茂遐怒道。
“朕仰慕先生久矣，方才做下此事。从与不从，请先生回答”，苏勒坦不为所动，手按刀柄逼问。
刘茂遐惨笑，“陛下以此相邀，臣如何敢不从！”
“哈哈哈~朕得玄初（刘茂遐字），如成吉思汗得耶律楚材焉！”苏勒坦可不管刘茂遐高不高兴，立即任其为福建巡抚，亲挽其手，设宴款待，宴后又彻夜长谈，极其信重。