10月17日，江西巡抚杨邦宪上疏请求为魏忠贤立生祠，朱由检看着笑而不语，魏忠贤赶紧上疏辞免为自己立生祠，朱由检顺水推舟的就答应了。
几日后魏忠贤主动向朱由检请求，辞去提督东厂的职务。朱由检好言安慰了几句，以让魏公公休息一段时间为名，让王承恩暂时接管了提督东厂。
不准江西巡抚修建生祠，又免去了魏忠贤提督东厂的职位，犹如一个风向标，顿时把朝中的局势给搅动起来了。
浙党徐大化见势头不妙，就暗示表侄御史杨维垣弹劾崔呈秀，袒护魏忠贤，来一个丢车保帅之计。
而工部主事陆澄源干脆来个将计就计，直接把矛头指向了崔呈秀，说当初熹宗夺情是因为三大殿没修好，现在三大殿已经修完了，崔呈秀还不请辞，霸着兵部尚书的位子，到底想干什么？
陆澄源的诛心之言，让崔呈秀立刻上疏请求罢免自己的职务，放他回去守制。
虽然朱由检对于这种守孝三年的规定很不以为然，但是在这种封建礼教为主流思想的社会，他还真没这个底气去挑战明朝的主流文化。
再说了，作为魏忠贤的铁杆，崔呈秀也不值得他费这么大力气。于是朱由检就答应了崔呈秀的请辞，不过对于崔呈秀空出来的兵部尚书，朱由检并没有同意让田吉上位，而是下令召回被发配去南京的前兵部尚书王在晋。
这些日子来，朱由检仔细研究了南北两京六部尚书的履历，发觉这位前兵部尚书对辽东的看法和合他的意思，因此就趁机把他给调了回来。
崔呈秀的去职，就像是阉党倒下的第一块骨牌。很快兵部主事钱元慤就跳出来疏劾魏忠贤，说崔呈秀的后台老板就是魏忠贤，请求革除魏忠贤一切职务，让他回乡下种田去。
朱由检对于钱元慤的上疏只是轻描淡写的责骂了几句，但是没有进行任何追究。
10月27日嘉兴贡生钱嘉徵再次疏劾魏忠贤，并列举了十大罪状。
这封疏劾内所谓的十大罪状，全都是一些道听途说，捕风捉影之事，朱由检对此简直嗤之以鼻。
不过他也知道事情应该到此为止了，再等下去这帮东林党人就更得寸进尺了。
于是当晚，朱由检把魏忠贤叫了过来，让王承恩把这上疏一条条的念给魏忠贤听。
魏忠贤一时汗如雨下，喃喃而不能自辩。朱由检看了魏忠贤很久，才忽然变成笑脸说道：“魏公公，看来你这些年真是得罪了不少人啊。”