但是这种形势却让孙中山非常振奋，他不管百姓死活的，只管自己到底能不能打倒北洋，夺得中华民国第一人的宝座，所以多次召集军事会议，甚至制定了护法北伐的进兵战略：令桂、滇两军肃清湘、川北军，出师合击武汉，其他各路护法军、靖国军也与桂、滇军会师武汉，然后占领南京，大举北伐，会攻北京，当然这个战略看看就好，别当真，美梦仔好，也只是梦，不会变真的。
说实话北洋军在湖南的失败不是败给了护法军，而是败给了自己人，这种结果完全是是直、皖两系矛盾分裂造成的，而且还加剧了这种矛盾。根本源头就是自张勋复辟这场风波后，黎元洪被迫下台，副总统冯国璋代理总统，段祺瑞重任国务总理，当然上台当权的还是北洋军阀，但是不一样的是段祺瑞彻底把持着整个中央政府大权，而冯国璋不过是空头把戏。
这样子就又造成了新的“府院之争”，直系首领、代总统冯国璋更是心生怨气，一直和皖系首领段祺瑞争夺北洋派正统地位及北京政府中央大权，这也就是北洋军阀内部的直皖之争，更为雄霸民国早期的北洋军彻底解体创造了条件。段祺瑞在上台之后，接收到孙中山在广州酝酿搞事的消息，决定先下手为强，于是任命皖系部下傅良佐为湖南督军，打算先拿下湖南作为进攻两广的基地，但是他偏偏不愿意让自己的军队出现损失，于是一个阴招出来了，皖当领导，却叫直系的军队去打先锋，这不是明明白白的坑招呀！就是个小孩都能看明白。而冯国璋也不是个善茬，他也想借助西南军阀的势力来削弱皖系，两人算是各怀鬼胎，但是段祺瑞手段更迅猛一点，冯国璋对段祺瑞利用直系军队打头阵的部署更是不满，于是直、皖的之间的矛盾越来越尖锐。
正是因为这样，冯国璋看出了段祺瑞不怀好意，彻底的认清了他的真面目，所以在段祺瑞主张“武力统一”的时候，冯国璋反其道而行之提出“和平统一”，当然是不想为他人做嫁衣，口头上的话说明不了他的决心，当即指使湖南前线的直系军队消极怠战，故意不攻，然后就在11月，湖南王汝贤、范国璋二人指挥直系军队在前线擅自停战撤兵。而这次行动，打乱了皖系夺取湖南的战略部署，算是彻底让段祺瑞的谋划付诸流水了。
对此，段祺瑞十分恼火，愤怒到向冯国璋提出辞职，可这有什么办法呢！难道你做初一还不允许别人做十五？这一昏招彻底让冯国璋冒出的野心之火熊熊燃烧起来，于是冯国璋索性暗示号称“长江三督”的湖北督军王占元、江西督军陈光远、江苏督军李纯发表联名通电，主张南北双方罢兵休战，当然那三个都跟他沆瀣一气，不过是弄给别人看的，或许他觉得这样分量不够，所以组织直隶、江苏、江西、湖北的直系军阀发表联合通电，主张和平解决南北问题。
这个深水炸弹够响亮，震惊全国，也震出了雄心，11月22日，冯国璋干脆免去国务总理段祺瑞，任命王士珍为国务总理，因为段祺瑞武力统一南方的政策被冯国璋彻底打破了，所以他干脆辞职，也显得面子上更好过，于是风靡全国多年的段祺瑞内阁再次倒台，但是，皖系军阀有实力，又有日本的支持，他们对实力弱小的冯国璋停战议和十分不满，更是因为自家老大都被人欺负了，所以纷纷上电，于是直皖两系公开分裂。