“右丞的决心已下，我也无话可说，不过，”既然忻都已经大包大揽的他也不好跟这个蒙古贵胄硬顶，但是为了确保胜利，他还是提出了自己的弥补方案。“是不是派出小队袭扰日本沿海，阻断日军增援太宰府。”
“也好。”忻都并不是听不进建议的人，久经战阵的他当然明白，洪茶丘的建议是有可取之处的。“就请洪大人安排一下吧。”说完这句，忻都一屁股坐倒了中间的案几后面。“传我的将令，大队即日向博多湾进发！”
六月六日，东路军舰队出现在博多湾附近海面。
与此同时，元军的另一只小型舰队出现在了长门海域，而元军进攻长门的消息，立刻震惊了镰仓幕府和京都。
民心不稳，舆论惊慌，以致市中无米，民有饥色。
“元军占领九州、元军已从东海、北海入侵等等”等谣言一个接着一个地传来，京都朝廷的公卿大臣尤为恐慌，在朝议中甚至有人主张迅速将朝廷迁往关东，招募武士浪人守卫京都等。
后宇多天皇亲临神宫祈祷七昼夜，龟山上皇在清水神社祈祷，又派人去伊势神宫祝词：愿以身代国难。
各王公大臣也纷纷向寺、社献币、写经、诵经。
北九州镇西守护所得知元军进攻对马、隐歧后，在镇西奉行少贰藤原经资率领下的守护部队立即进入沿海石坝阵地，严阵以待。
总指挥仍为前次抵御元军进攻的藤原经资，大友赖泰作副手，在他们领导下，有藤原领导的“三前二岛（注：筑前、丰前、肥前、壹崎岛、对马岛）”的御家人武士部队、大友统率的丰后武士部队、筑后守护北条宗政、肥后守护安达成宗的、以及岛津久经所率领的萨摩、大隅、日向三地的守护武士部队。
参加第一线的战斗人员大约有四万余人，连藤原经资的父亲、八十四岁的入道觉惠都积极地参战。
此外，四国和中国地方部分御家人和武士，参加了九州的战争，宇都宫贞纲率领约六万中国地方的武士部队，作为增援军在必要时将前往筑前。
元军舰队驶进博多湾才发觉，沿海滩头筑有石坝，登陆战的实施困难很大。
忻都派出小股部队，侦察终日，始知志贺岛和能古岛防御薄弱，未筑石坝，遂命令舰队靠近志贺岛下锚。
元军第一次攻入博多湾，是以突然袭击而得手的，第二次攻入侦察终日未能登陆，为日军防御赢得了整整一天时间，已不再是突袭而是强攻了。
六月六日夜幕降临时，熟习近海作战的松浦党御家人草野次郎经永，率少数部下分乘两小舟偷袭元军，是、纵火焚船，乘元军慌乱之际斩首二十一级。
这一果敢行动引诱其他武士效法，偷袭元军彻夜不断。
元军为预防偷袭，将大船调于外围，日本船小难以正面冲击。偷袭者至，元军以石、矢投射，日本武士的小船非碎即穿，损失逐渐增加。
日军统帅藤原经资下令，若无命令不准进行偷袭。
七日晨，由洪茶丘所率元军登陆占领志贺岛，与元海军形成犄角之势，扩大了占领区。
在博多湾的南侧，有一条狭长的半岛，在半岛的西北角，隔着一泓碧水，竦峙着一座小山那便是志贺岛。
八日和九日，元日两军的陆战，就集中于这个狭长的岛屿之上。
志贺岛在海潮退时，露出海滩直通陆地，元军试图从海滩突破，进攻博多守军后路，因此杀争夺战相当激烈。
随着战斗的进行，高丽军也投入了这场争夺战。
此时，日军副指挥大友赖泰之子大友贞亲亲率日军突入，击退元军和高丽军，并一度制洪茶丘于险地，幸亏王姓万户长率军抢救，战退日军，洪茶丘方免于难。
九日，日军又发起进攻。
在这狭长的滩头阵地，元军不能发挥其所长，恰好适应了日本武士一人一骑的战斗方式，因而元军伤亡很大，战斗进行到六月十三日，元军未能前进一步。
这时正值六月（公历7月）盛夏，长期船上生活和战斗，蔬菜、饮水供应困难，疫病不断发生，病死者已达三千余人。
元军处境不妙，抢占博多湾的计划已难以实现。
因此，忻都等决定，于六月十五日率军撤离了志贺岛，重新驶向壹歧岛，与南路军会师后再行进军九州。