在新纵横、新法家变为各种一级学科、二级学科之后，大明乃至世界的政治、外交和律法学科体系也算是正式诞生了。
在此之前，外交和律法很大程度从属于官方，不算是一个社会科学的学科，而且即使在近代科学萌芽初期，也是自然科学崛起压过社会科学。
华夏的诸子百家其实有一个特点，那就是政治学派和社会学派比较多，朱由校一点也不觉得大明的“先秦复兴”就是复制欧洲的“文艺复兴”，而是弯道超车不仅超过“文艺复兴”，而且超过之后的“大航海”时期，直接追上“三十年战争”时期。
而这个弯道超车，在自然科学方面很多是靠自己带来后世的科学技术，可在社会科学方面更多是靠华夏政治学派和社会学派本身身后的底蕴，直接积累了大量人才在朱由校引领下一起发力完成超越。
新纵横家和新法家就很明显，这种政治学科体系门类比较健全，人才也都有用武之地，既能在大明官方民间各有任职，也能不受官府干扰把社会科学本身建设好。
如果说新纵横家和新法家变为学科之后偏政治学，那么新阴阳家就更偏哲学、逻辑学和文理综合了。
新阴阳家的主要头脑比较神秘，朱由校一直没让他们多露面，但今天是在全国面前堂堂正正站了出来。
主要首脑三人：刘若愚、温体仁和宋献策。
刘若愚是朱由校身边的最主要机密助手。温体仁是明面搞档案的阳谋，背地按照朱由校指示坑欧洲人的策划者。还有宋献策，是这个时代老阴阳家的最突出人物之一，也是从老阴阳家变为新阴阳家的领头人物。
老阴阳家的思想主要源于道家的“阴阳说”和“五行说”。春秋时期诸多先哲就谈论到阴阳，如《老子》谓“万物负阴而抱阳”；《易传》谓“一阴一阳之谓道”。到战国及之后阴阳和五行渐渐合流，形成以“阴阳消息，五行转移”为理论基础的宇宙观。
之后其实也不算衰落，阴阳五行培生出玄学，玄学是与科学并列的认知自然的知识体系，天文、历法、堪舆、中医、术数，这些学科都属于玄学。魏晋玄学又吸纳西方传来的释迦摩尼思想，成为当时接近主流的哲学思想。
玄学算是近代以前人类认识自然世界的知识的朦胧与混沌哲学体系，到了近代进入科学时期，当然人类认识世界从抽象混沌要变为逻辑严密的抽象规律。
新阴阳家就做到了这点，而且对于科学方法论贡献很大。
朱由校推动刘若愚、温体仁和宋献策这三位，从决策到官方再到民间，把阴阳辩证统一，运用了矛盾辩证法，在数学、哲学、物力、逻辑、自然、美学等都做了具体辩证法的运用。
此时新阴阳家也将变为科学，不再作为一个政治派别了。
新阴阳家设定五门一级学科：力学、中医学、哲学、天文、数学；二级学科十几个包括养生学、逻辑、易经、美学、矛盾辩证学、历法、地理、自然、化学等等。
阴阳家的堪舆仍然保留，在地理学内部作为一个学科发展发那个像，作为研究风水与自然地理的相关联系与差异，阴阳家认为风水与这些因素属于同一范畴。
其他新百家对于新阴阳家保留堪舆学科莫衷一是，比如新兵家就比较支持、新纵横家就持保留意见，当然朱由校、徐光启和刘若愚是支持的。
新阴阳家转变为有文科、有理科，是一个重头戏。
新杂家当然也还是类似，主要分到系统工程和学科统筹的两大方向之中，发挥他们把不同学科结合运用的优势。