云贵等地的改土归流过程并不算顺利。
监国元年十月下旬，傅鼎铨正式宣布在云贵两省推行改土归流政策，他从到贵阳任职到现在一直都在收集两省土司中所犯有不法之事的罪证，其中包括但不限于崇祯年到迄今为止的各类罪证以及秦楚之战中骑墙、攻击过楚军的敌对行动等等。
这些不法土司便是傅鼎铨拿来开刀的第一个对象，他以云贵总督的名义要求这些不法土司主动献出领地，表示只要他们自愿献土，不仅之前的一切既往不咎，还能保留他们世代积累下来的钱财。
可若是在朝廷大军杀至以后再投降，可就没那么好了，不仅土司保不住，家族世代积累的财富也会被朝廷充公。
傅鼎铨的通告一经发布，顿时在云贵两省引发了一场轩然大波，各地土司纷纷骚动起来，他们中的大部分人都不愿意将家族世代继承的土地让给朝廷，但同时也恐惧武力强大的楚军。
傅鼎铨只给他们不到半个月的决定时间，在这期间，他开始以总督的名义调动兵马进行备战。
眼见楚军开始备战，许多实力弱小或是已经在战争中元气大伤的土司虽然仍然不愿意献出土地，但也是心生胆怯。
十月底，一些弱小的土司率先做出决定，他们主动向傅鼎铨交出世袭领地及土司印信，归政朝廷，傅鼎铨随即在这些地方设立州县村。
对于那些主动献土的土司，傅鼎铨也在规定范围内对其酌加赏赐，或予世职，或给现任武职，他们就像是起到了表率的作用，其余一些实力不强的土司见状，也都纷纷效仿。
不过有人献土就必然有人选择反抗，许多土司不愿意将自己世袭的土地和官职拱手相让，决定孤注一掷，以武力进行抵抗。
十月三十，贵州长寨土司率先掀起叛乱，土司大军攻陷了附近的县城，生擒当地知县，那知县被绑在树上，对着反叛土司高声辱骂，那土司恼怒之下直接点火将知县活活烧死。
随后，土司兵洗劫了县城内外，杀死大量汉民，在撤离时纵火焚城，长寨土司的反叛震动全贵州，消息传开后，还没等楚军开始调动，其他等地不愿俯首的土司也纷纷起兵叛乱，贵州各地硝烟四起。
云贵总督傅鼎铨听闻长寨土司的暴行，大为愤怒，但他还是强压下心中的怒火，沉着冷静的调兵遣将，镇压各地土司叛乱。
他命贵州总兵赖洵率领本部兵马攻打长寨土司，命副总兵陈世泰与卢山伯刘镇国、郭李爱跟随自己亲征黎平府古州跟随叛变的苗、黎土司。
由于改土归流主要在贵州境内推行，云南的土司反应并没有贵州土司那么激烈，在贵州土司多处叛乱之时，云南除了偏远边陲爆发了小规模叛乱外，其余各地都还相安无事。
这或是是因为苏定远的大军此时还在云南境内，土司们没有头铁到敢在楚军主力眼皮子底下起事。
言归正传，贵州楚军在傅鼎铨的命令下早已做好了平叛准备，因此根本无需动员，大军直接开拔，杀向叛乱的土司属地，大军所到之处，原本还在两者间观望的土司纷纷倒向楚军，“自愿”献出了家族世代承袭下来的领土，得到了比开战前主动献土的土司们更低的嘉奖。