数码宝贝世界，第二大宇宙。
跟第一宇宙大不相同，20世纪中叶，互联网的原型在冷战背景下孕育而生，逐渐成为发达国家极具潜力的虚拟战力，在这一时期，包括d—reaper（帝厉魔数码死神）在内的各种早期元素相继产生。至70年代中期，得益于相关计划的顺利开展，数码世界在大国的共同架构下成功的以一种原始的姿态现世。而早期的虚拟人工智能生命“数码精灵”作为一种技术突破，被引入到网络世界之中，成为数码世界最早的“生物”，为后期的数码兽奠定了基础。到了80年代，聚集世界各国年轻网络精英的野生动物研究小组在罗伯麦考伊的带领下，创造出了最早的原始数码兽，数码世界一度成为这些青年骨干们挑战未来的梦想。而原始数码生物们起初无法理解作为造物主的人类，在它们眼中，人类是父母，更是神。
但是这个虚拟世界的深层与量子背景之间存在神秘的联动关系，其活性化将产生不可估量的未知隐患，这份担忧很快被证实，雄心勃勃的数码世界建造计划随之叫停，不久后彻底从人类视线中抹除。但是当时产生的诸多形象在商业化后成为了风靡少年群体的娱乐平台。
可是，数码世界的幸存者却在移出人类世界后，开始接触互联网高速发展产生的海量数据，逐渐成为远超出人类想象的虚拟空间，被人类抛弃的数码兽不再信奉人类为造物主，转而投靠最早崛起的一批同类，由此产生了诸多势力。数码世界的膨胀一直持续到新世纪，期间也遭到过帝厉魔等人类自动监察系统的绞杀，但当数码世界重新回到人类视线时，其性质早已发生巨变。
人类文明转入21世纪，十分热爱数码兽、稍微有点率真，个性极普通的小学五年级男生松田启人设计出了一只数码兽，对他来说与朋友玩数码兽卡片游戏，上课时偷偷地把自己创作的数码兽画在笔记簿上，就是他最大的乐趣！
原著的故事，便是从这里开始的。但是我们的故事，却并非从这里开始。而是在东京的另一个角落五角大厦顶楼上。
一个身着黑色休闲西装的男子，一脸冷然的观望着人类的世界，一头火红色的头发在高楼狂风的吹袭下剧烈摆动。这个人并不是别人，正是完成了融合的凌霄。
为了修补数码宝贝世界的残缺，凌霄唯有留在数码宝贝世界，让他一直忙于修补的工程，那是绝对不可能的，虽然并不是没有耐心，但是未免有些无聊。且融合了兽体和人体的他，拥有随时将兽体与人体自由分散的能力。
这就造成了凌霄用兽体去修补数码宝贝世界的空洞，而他的人体，则是到了数码宝贝世界的第二宇宙，也看看这第二宇宙的情况跟第一宇宙的差别。
来到第二宇宙，已经有整整一天的时间了，依照他的了解，剧情很快就会开始，所以他才一直在这里等候着。
他还隐约记得数码宝贝第三部驯兽师剧情的开始，就是在这五角大厦不远的中心公园里面。
眺望远方，太阳已经渐渐落山，一种奇妙的感觉袭上他的心头，他有预感，今天晚上，这附近一定会发生意想不到的事情。
“呵呵快点出现吧，我可是无聊了几百年，可别让我失望啊。”双手抱胸，凌霄喃喃自语的说了一句，自从完成合体之后，凌霄的实力便提升到了一个恐怖的高度，虽然此刻他的人体和兽体呈分裂状态，但是他此刻所能控制的实力，也远超当年的宇智波斑。