“我部奉命剿灭横行在贡噶、扎朗一带的贡布扎西匪帮。贡布扎西是个大胖子，很凶悍，脸上有道长长的刀疤。他在贡噶，奸淫掳掠达两个月之久，从农奴们手中搜刮了大量青稞、面粉和酥油，用光了全部马草，拉走了所有的骡马，整个村庄一片凄凉。在扎朗，他的部下侮辱了所有的妇女。听说要剿灭他，将士们憋着一团火，打得特别勇猛。刚一开战，叛军便开始溃逃，一直逃到“圣湖”纳木错岸边。在我们不断地搜剿下，他们的人数越来越少，贡布扎西和几个部下被我们包围在湖边，绝望中跳入纳木错湖”（坚参次仁：《雪域高原百日记》）。
“乌郁宗有个叫桑培的坏和尚，很凶残，办一场法事就要二十个头盖骨、三十张人皮、大量的人骨和人血，死在他手里的朗生（最低等的农奴）不计其数。都百户绰思吉率军去剿灭他，我带着一百名勇士为先锋。到达乌郁宗时，我和几个士兵暂住在朗生多普基家。多普基的双腿就是被桑培打断的，一家三口靠编筐艰难度日，连青稞糌粑都很难吃到，只能吃粗劣的豌豆糌粑、喝糊糊。可听说我们要去打桑培，他将家里唯一的一块青稞糌粑给了我们。我们追着叛匪桑培部狂追猛打，他的腿很长，先是逃到山南，接着又逃到不丹，然后便失去了消息。没有抓住桑培，真是一件很遗憾的事，每回我想起多普基给我的那块青稞糌粑，总感觉很惭愧”（坚参次仁：《雪域高原百日记》）。
叛乱在拉萨失败后，前藏一带叛军残部的内部关系开始变得恶劣，其固有的叛首与叛众之间、康巴人与卫藏人之间、各派系之间的种种矛盾更加激化，往往发展到自相残杀。很多百姓都亲眼看到叛军各部因为争夺粮食、马匹而发生火井。
总体来说，拉萨的局势开始平稳。巴图和坦、铁钼尔、那苏图三位阁老兴高采烈地向乾元皇帝上疏，汇报自己在平叛中的卓越表现，他们完全忽略或者看不到普通百姓在平叛中的功劳。然而，后世的史家们一致认为，民心的向背对平叛起到了重要作用。《大卫律》的颁布发行，乾元帝减免税赋、众生平等、鼓励贸易、发展经济的施政方向，赢得了相当一部分百姓，尤其是中下层百姓的支持。他们为官军提供情报，运送给养，甚至拿起武器助战，对迅速平叛居功至伟。这一点，从当时人们留下的各种记录中可以看得很清楚。
历史是由千千万万个普通百姓创造的，而不是由那些皇帝伟人、王侯将相们创造，乾元朝的阁老们看不到普通百姓的作用，不懂得发挥普通百姓的作用，因而无法彻底根除叛乱的土壤。很快，日喀则、山南便又燃起熊熊的叛乱之火。